Mientras busca en el ático de su abuelo, Hikaru Shindou se topa con una vieja tabla de go. Al tocarlo, es recibido por una voz misteriosa y poco después cae inconsciente. Cuando recupera sus sentidos, descubre que la voz todavía está presente y pertenece a Fujiwara no Sai, el espíritu de un antiguo experto en go. Instructor de go del emperador japonés en la Era Heian, la pasión de Sai por el juego trasciende el tiempo y el espacio, lo que le permite continuar jugando su amado juego como una entidad fantasmal. El objetivo final de Sai es dominar una técnica divina que ningún jugador ha logrado hasta ahora, y busca lograrlo jugando el juego de mesa a través de Hikaru. A pesar de no tener ningún interés en los juegos de mesa, Hikaru accede a jugar de mala gana, ejecutando movimientos según las instrucciones de Sai. Sin embargo, cuando se encuentra con el joven prodigio Akira Touya, la pasión por el juego se enciende lentamente dentro de él. Inspirado por su nuevo rival, el viaje de Hikaru al mundo del go apenas comienza.